Unter www.bahn.de/schwartwaldbahn können Reisende Zugverbindung und -tag auswählen und danach einen individuellen Sitzplatz aussuchen. Mit einer Reservierungsbestätigung zum Ausdrucken hält man schließlich auch die Legitimation für "seinen" Platz in der Hand. Der Reservierungsbereich findet sich immer im Obergeschoss des Steuerwagens und ist gesondert gekennzeichnet.
Reservierungen auf der Strecke zwischen Karlsruhe und Offenburg sind werktags für besonders stark nachgefragte Züge aus Rücksicht auf Pendler ausgenommen.